http://synergy-foss.org/spit/issues/details/3561/

vmwareのマウス切り替えとsynergyのスクリーン切り替えがコンフリクトするらしい.その結果synergysがSegmentationFaultエラーを出す.Vmwareウインドウの境界とsynergyの境界を同時(短時間の間)に越えると必ず落ちる.

対策はsynergy.confにswitchDelayを設定すること.

section: options
    switchDelay: 500
end

これでほぼ落ちることはなくなった.